El
logotipo es una abstracción de las cúpulas, las cuales son el símbolo representativo de
San Ángel, y lo que llama mas la atención, por lo que este símbolo es lo óptimo para
el museo. Se buscó que el logotipo representara las cualidades del museo. Estas
cualidades son cultura y antigüedad, por el tipo de obras que se exponen, de los siglos
XVI y XVII. Este logosímbolo trata de identificar a la institución disociando el
concepto de espacios religiosos por el de espacio cultural.
